RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GTF3C6Q969F1 213 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPATA32Q96LK8 384 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DCCP43146 1447 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JCADQ9P266 1359 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL2RBP14784 551 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LIG1P18858 919 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GUL7 405 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EYA2O00167 538 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0G2JLW4 131 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GORABQ5T7V8 394 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHST3Q7LGC8 479 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MCM5P33992 734 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC192P0DO97 292 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APOBRQ0VD83 1088 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCRN1Q12765 414 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DACT1Q9NYF0 836 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM89AQ96GI7 184 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KDM4AO75164 1064 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BICD2Q8TD16 824 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TPM2P07951 284 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAP3K11Q16584 847 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WASHC4Q2M389 1173 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNMDQ9H2S6 317 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADORA1P30542 326 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAST3O60307 1309 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ELP1O95163 1332 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPR108Q9NPR9 543 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLAIN2Q9P270 581 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCC6O95255 1503 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 E7EWF7 191 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R2C6 588 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPC24Q8NBT2 197 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PALLDQ8WX93 1383 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HAND2P61296 217 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCIRG1Q13488 830 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYNE4Q8N205 404 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AP5Z1O43299 807 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPTP24298 496 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GUCY1B3Q02153 619 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TYRO3Q06418 890 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OSBP2Q969R2 916 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PFKFB2O60825 505 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NR1I2O75469 434 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RESTQ13127 1097 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XAGE2Q96GT9 111 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GLI3P10071 1580 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LUZP1Q86V48 1076 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PGBD1Q96JS3 809 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CIAO1O76071 339 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms