RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565483.1

STX4-215, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 5

Gene STX4, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-215	ENST00000565483	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.01	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	EYA3	Q99504	573 aa		28.01	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	IL16	Q14005	1332 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	CAPN15	O75808	1086 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	GRM1	Q13255	1194 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	CST9	Q5W186	159 aa		28	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.99	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483		H7C1D1	291 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	CTSW	P56202	376 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.96	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.96	■■■□□ 2.07
STX4-215	ENST00000565483		G3V3G9	751 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	EGFR	P00533	1210 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	FLII	Q13045	1269 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	DPF2	Q92785	391 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	GREM2	Q9H772	168 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	XDH	P47989	1333 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.9	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	VAMP4	O75379	141 aa		27.9	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.9	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483		H7C1W4	665 aa		27.89	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	GCKR	Q14397	625 aa		27.89	■■■□□ 2.06
STX4-215	ENST00000565483	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		27.88	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	AOC2	O75106	756 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	ECE1	P42892	770 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	LBX1	P52954	281 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.87	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483		F6X3S4	739 aa		27.84	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.84	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.84	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	MYH3	P11055	1940 aa		27.84	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	CASP7	P55210	303 aa		27.83	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.83	■■■□□ 2.05
STX4-215	ENST00000565483	ITGA6	P23229	1130 aa		27.82	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.81	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.81	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.81	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.8	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.8	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.79	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.79	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.79	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.79	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	TSKS	Q9UJT2	592 aa		27.79	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	HUNK	P57058	714 aa		27.78	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.78	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.78	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.78	■■■□□ 2.04
STX4-215	ENST00000565483	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.78	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms