RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMD14	O00487	310 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	GGA1	Q9UJY5	639 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	CTSW	P56202	376 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	FLII	Q13045	1269 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	GRM1	Q13255	1194 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	RASSF10	A6NK89	507 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP4C-208	ENST00000564966	XDH	P47989	1333 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	DPF2	Q92785	391 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	GREM2	Q9H772	168 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	VAMP4	O75379	141 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	RTL9	Q8NET4	1388 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	GCKR	Q14397	625 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966	CST9	Q5W186	159 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4C-208	ENST00000564966		H7C1W4	665 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	FOXN1	O15353	648 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2B4	P23634	1241 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH3	P11055	1940 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	CAPN15	O75808	1086 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	ECE1	P42892	770 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	USP48	Q86UV5	1035 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	CAPNS2	Q96L46	248 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4C-208	ENST00000564966	EGFR	P00533	1210 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGA6	P23229	1130 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	WBP1L	Q9NX94	342 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966		F6X3S4	739 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM161A	Q3B820	660 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXW7	Q969H0	707 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	PODN	Q7Z5L7	613 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	USP17L3	A6NCW0	530 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	USP17L4	A6NCW7	530 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNJ4	P48050	445 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	DLK2	Q6UY11	383 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	MED23	Q9ULK4	1368 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	LBX1	P52954	281 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	CASP7	P55210	303 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	ADM5	C9JUS6	153 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	GGA3	Q9NZ52	723 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	AOC2	O75106	756 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	SULF1	Q8IWU6	871 aa		32.18	■■■□□ 2.74

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