RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562311.5

KIFC3-209, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-209	ENST00000562311	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	ANP32C	O43423	234 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	UFL1	O94874	794 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	CTSW	P56202	376 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	GREM2	Q9H772	168 aa		32.52	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	MYH3	P11055	1940 aa		32.51	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	FLII	Q13045	1269 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	VAMP4	O75379	141 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	WBP1L	Q9NX94	342 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	CAPN15	O75808	1086 aa		32.48	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	EYA3	Q99504	573 aa		32.48	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	GGA1	Q9UJY5	639 aa		32.48	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	CASP7	P55210	303 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311		H7C1W4	665 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	GRM1	Q13255	1194 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	DPF2	Q92785	391 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	CAPNS2	Q96L46	248 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
KIFC3-209	ENST00000562311	PSME4	Q14997	1843 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311		H7C1D1	291 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	GCKR	Q14397	625 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	USP48	Q86UV5	1035 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	XDH	P47989	1333 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	AOC2	O75106	756 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	ADM5	C9JUS6	153 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311		F6X3S4	739 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	FAM161A	Q3B820	660 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	KLRK1	P26718	216 aa		32.39	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	LBX1	P52954	281 aa		32.39	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
KIFC3-209	ENST00000562311	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF609	O15014	1411 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	ATP2B4	P23634	1241 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	GML	Q99445	158 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	ITGA6	P23229	1130 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	GGA3	Q9NZ52	723 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	MED23	Q9ULK4	1368 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	CSF1R	P07333	972 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.32	■■■□□ 2.77
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311		G3V3G9	751 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311	SNAP23	O00161	211 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-209	ENST00000562311	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		32.32	■■■□□ 2.76

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