RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934		J3QW42	95 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	SIN3B	O75182	1162 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ADH6	P28332	368 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ACD	Q96AP0	544 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	PLAUR	Q03405	335 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	CPB1	P15086	417 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ACPP	P15309	386 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ADH7	P40394	386 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	NRL	P54845	237 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SIK1	P57059	783 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	HYAL2	Q12891	473 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	TRPA1	O75762	1119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	IRS1	P35568	1242 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SOX18	P35713	384 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GPLD1	P80108	840 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	EPX	P11678	715 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ALAS2	P22557	587 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	CEP120	Q8N960	986 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	MDFI	Q99750	246 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	OIP5	O43482	229 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	KIF4A	O95239	1232 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GHRH	P01286	108 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	BCR	P11274	1271 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ATP11A	P98196	1134 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PCSK7	Q16549	785 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PP55	124 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	EDN3	P14138	238 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LINS1-210	ENST00000560934	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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