RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 XAGE2Q96GT9 111 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 ZMYND15Q9H091 742 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 NOD1Q9Y239 953 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 FOXO3O43524 673 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 GTF2IP78347 998 aa6.1□□□□□ -1.43
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TMOD3-204ENST00000558666 TLR1Q15399 786 aa6.1□□□□□ -1.43
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TMOD3-204ENST00000558666 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.1□□□□□ -1.43
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TMOD3-204ENST00000558666 POU4F2Q12837 409 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 WDR44Q5JSH3 913 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-204ENST00000558666 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.09□□□□□ -1.43
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TMOD3-204ENST00000558666 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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TMOD3-204ENST00000558666 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 COL18A1P39060 1754 aa6.06□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.05□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.05□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 USP3Q9Y6I4 520 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.05□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 PHKA2P46019 1235 aa6.04□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 EPHA4P54764 986 aa6.04□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 SIX5Q8N196 739 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 OGFOD1Q8N543 542 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 GPAMQ9HCL2 828 aa6.04□□□□□ -1.44
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