RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 LIG1P18858 919 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 CAMK4Q16566 473 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 PIGBQ92521 554 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 PI16Q6UXB8 463 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 GTF3C6Q969F1 213 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 GPTP24298 496 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 FGD1P98174 961 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 SCRN1Q12765 414 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 M0R2C6 588 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 SCARF1Q14162 830 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 KRT32Q14532 448 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 MAST3O60307 1309 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 APOBRQ0VD83 1088 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM260-216ENST00000557657 KRT85P78386 507 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 PLCB2Q00722 1185 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 TCIRG1Q13488 830 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.14■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 HLFQ16534 295 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 OSBP2Q969R2 916 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 HS1BP3Q53T59 392 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 PALLDQ8WX93 1383 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 TNS2Q63HR2 1409 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 AP5Z1O43299 807 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 PDCP20941 246 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 HAND2P61296 217 aa25.11■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 XAGE2Q96GT9 111 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 ATG3Q9NT62 314 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 BTG4Q9NY30 223 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 GPR108Q9NPR9 543 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.1■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 CTDNEP1O95476 244 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.09■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
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TMEM260-216ENST00000557657 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 DACT1Q9NYF0 836 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM260-216ENST00000557657 FOXP2O15409 715 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 OFD1O75665 1012 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 PAPPAQ13219 1627 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 CIAO1O76071 339 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 ZAP70P43403 619 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 WASHC4Q2M389 1173 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 PGBD1Q96JS3 809 aa25.07■■□□□ 1.6
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TMEM260-216ENST00000557657 GUCY1B3Q02153 619 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 IFFO2Q5TF58 517 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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TMEM260-216ENST00000557657 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 GREM2Q9H772 168 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TMEM260-216ENST00000557657 LAMA4Q16363 1823 aa25.04■■□□□ 1.6
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