RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.16□□□□□ -0.78
GNPTAB-208ENST00000550718 DYRK3O43781 588 aa10.15□□□□□ -0.78
GNPTAB-208ENST00000550718 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.15□□□□□ -0.78
GNPTAB-208ENST00000550718 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.15□□□□□ -0.78
GNPTAB-208ENST00000550718 USP21Q9UK80 565 aa10.14□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 ARID3CA6NKF2 412 aa10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 J3QW42 95 aa10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 MUC3BQ9H195 1237 aa10.13□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 DLL1O00548 723 aa10.11□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 ZBTB39O15060 712 aa10.11□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 HELQQ8TDG4 1101 aa10.11□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 KIF4AO95239 1232 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 HYAL2Q12891 473 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 XP32Q5T750 250 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 Q8N3U1 123 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR152Q8TDT2 470 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 SEPT3Q9UH03 358 aa10.1□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.09□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.09□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 SPACA7Q96KW9 195 aa10.09□□□□□ -0.79
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.08□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 XKR5Q6UX68 686 aa10.08□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.08□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 SSFA2P28290 1259 aa10.07□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.06□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 PPME1Q9Y570 386 aa10.06□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 PCSK2P16519 638 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 NOS3P29474 1203 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 SCNN1AP37088 669 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 SETDB1Q15047 1291 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 TP53INP1Q96A56 240 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 ELP3Q9H9T3 547 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.05□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.04□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 NPR3P17342 541 aa10.03□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.03□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP120Q8N960 986 aa10.03□□□□□ -0.8
GNPTAB-208ENST00000550718 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.02□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 PBX4Q9BYU1 374 aa10.02□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 MTMR7Q9Y216 660 aa10.02□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP135Q66GS9 1140 aa10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 Q6ZS46 218 aa10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 ATCAYQ86WG3 371 aa10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.01□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 F8W735 103 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 PDGFAP04085 211 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 CDC27P30260 824 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP11AP98196 1134 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC51AQ86UW1 340 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 NCAPG2Q86XI2 1143 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 EDEM1Q92611 657 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 PMEPA1Q969W9 287 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 MEGF10Q96KG7 1140 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 RASSF4Q9H2L5 321 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAM19Q9H013 955 aa9.99□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 MPSTP25325 297 aa9.98□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.98□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 TTC16Q8NEE8 873 aa9.98□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 TM4SF5O14894 197 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM13AO94988 1023 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 PTPRAP18433 802 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 USP5P45974 858 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 WNT8BQ93098 351 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 CNTN3Q9P232 1028 aa9.97□□□□□ -0.81
GNPTAB-208ENST00000550718 CES1P23141 567 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 EHHADHQ08426 723 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.96□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM177BA6PVY3 158 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms