RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MCTP2Q6DN12 878 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 SPC24Q8NBT2 197 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 INCENPQ9NQS7 918 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 HOXC9P31274 260 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 UBXN4Q92575 508 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRKQ15262 1439 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 F6X3S4 739 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 GNA11P29992 359 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 ERBB4Q15303 1308 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 TTC6Q86TZ1 520 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 POLKQ9UBT6 870 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PP64 1363 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0232Q92628 1395 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 PDE1AP54750 535 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 KRT13P13646 458 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM87BQ96K49 555 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRB-208ENST00000550358 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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PTPRB-208ENST00000550358 NLRP1Q9C000 1473 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRB-208ENST00000550358 STK32BQ9NY57 414 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 ABCA8O94911 1581 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 PSMA7O14818 248 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-208ENST00000550358 NT5C2P49902 561 aa9.7□□□□□ -0.86
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