RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534407.5

ROBO4-210, Transcript of roundabout guidance receptor 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ROBO4, Length 3,904 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO4-210ENST00000534407 F13A1P00488 732 aa14.7□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 BARGINQ6ZT62 677 aa14.7□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.7□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SYT1P21579 422 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SIK1P57059 783 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 RNF214Q8ND24 703 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SLC5A1P13866 664 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 VPS37DQ86XT2 251 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 MRC1P22897 1456 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 FSD2A1L4K1 749 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 UBE2HP62256 183 aa14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NECTIN1Q15223 517 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 USP48Q86UV5 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 FERMT3Q86UX7 667 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 PANK2Q9BZ23 570 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 TAF5LO75529 589 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 LRRC24Q50LG9 513 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 Q6ZUG5 572 aa14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 PDE8AO60658 829 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ITGA6P23229 1130 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 FOSBP53539 338 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 VPS72Q15906 364 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 BRF1Q92994 677 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 XAGE2Q96GT9 111 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ZNF445P59923 1031 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 TICAM2Q86XR7 235 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SPATA32Q96LK8 384 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 DDX11Q96FC9 970 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CFAP45Q9UL16 551 aa14.66□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 TNS2Q63HR2 1409 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ZNF213O14771 459 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 FOXO4P98177 505 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CERKQ8TCT0 537 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 AIDAQ96BJ3 306 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 PARP10Q53GL7 1025 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.65□□□□□ -0.06
ROBO4-210ENST00000534407 MAP3K12Q12852 859 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 TTC14Q96N46 770 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 IL25Q9H293 177 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 BCL9O00512 1426 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 TRIM29Q14134 588 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 CTSWP56202 376 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 ME3Q16798 604 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 ERICH2A1L162 156 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 ZPR1O75312 459 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 PALLDQ8WX93 1383 aa14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.62□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 ESPNB1AK53 854 aa14.62□□□□□ -0.07
ROBO4-210ENST00000534407 NLRP10Q86W26 655 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms