RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXO3Q9UK99 471 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 GPSM2P81274 684 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP85Q6P2H3 762 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 SSH3Q8TE77 659 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 AAMPQ13685 434 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 POLA2Q14181 598 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 VPS33BQ9H267 617 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 XDHP47989 1333 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 EYA2O00167 538 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 RASSF7Q02833 373 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 CHRNDQ07001 517 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 CIAO1O76071 339 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LMNB1P20700 586 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP2B4P23634 1241 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 GGA1Q9UJY5 639 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC24Q50LG9 513 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 POLLQ9UGP5 575 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 UTRNP46939 3433 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 PRELPP51888 382 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 HMMRO75330 724 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 EYA3Q99504 573 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 C6orf229H3BNL8 230 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 UFL1O94874 794 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 METTL24Q5JXM2 366 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SIL1Q9H173 461 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 LTBP1Q14766 1721 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 TAF5LO75529 589 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 WASHC4Q2M389 1173 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF181Q9P0P0 153 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SPEF2Q9C093 1822 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 PDE8BO95263 885 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE4AQ14139 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 PPIP5K2O43314 1243 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNJ4P48050 445 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 MED23Q9ULK4 1368 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 AOC3Q16853 763 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 JDP2Q8WYK2 163 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 SBF1O95248 1867 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 SNAP23O00161 211 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 RIMBP2O15034 1052 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 FGFR2P21802 821 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 NIM1KQ8IY84 436 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 FZD9O00144 591 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 SASH1O94885 1247 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 TFCP2Q12800 502 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 LPIN2Q92539 896 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 CHD4Q14839 1912 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 COA1Q9GZY4 146 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR108Q9NPR9 543 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms