RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532749.1

TMEM25-223, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-223	ENST00000532749	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	SOX10	P56693	466 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	EYA3	Q99504	573 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	TAF1	P21675	1872 aa		18.33	■□□□□ 0.53
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC10A3	P09131	477 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	RUNDC1	Q96C34	613 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	CDCA5	Q96FF9	252 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	GGA3	Q9NZ52	723 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	COL4A1	P02462	1669 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	SCARF1	Q14162	830 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	SULF1	Q8IWU6	871 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	LAMB2	P55268	1798 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	UFL1	O94874	794 aa		18.29	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		18.29	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749		G3V3G9	751 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC184	Q52MB2	194 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	HYPK	Q9NX55	129 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	GML	Q99445	158 aa		18.27	■□□□□ 0.52
TMEM25-223	ENST00000532749	HOXB7	P09629	217 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	USP17L8	P0C7I0	530 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	MYD88	Q99836	296 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	MXD3	Q9BW11	206 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	USP17L3	A6NCW0	530 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	USP17L4	A6NCW7	530 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	FKBP1B	P68106	108 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	PDE8A	O60658	829 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	GOLGA2	Q08379	1002 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	PODN	Q7Z5L7	613 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TMEM25-223	ENST00000532749	APAF1	O14727	1248 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	MRS2	Q9HD23	443 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	XDH	P47989	1333 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TMEM25-223	ENST00000532749	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		18.19	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms