RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SOX18P35713 384 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf34Q49A92 452 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM11Q96F44 468 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PLVAPQ9BX97 442 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 POLIQ9UNA4 740 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ICMTO60725 284 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 DCAF5Q96JK2 942 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 GHRHP01286 108 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 COL8A1P27658 744 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NCAPD3P42695 1498 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 J3QW42 95 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 BRD1O95696 1058 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SIK1P57059 783 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PERM1Q5SV97 790 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 OR13H1Q8NG92 308 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 RBSNQ9H1K0 784 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ELP3Q9H9T3 547 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 A6NHS1 94 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NID1P14543 1247 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 USP5P45974 858 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 FZD6O60353 706 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 HMGXB3Q12766 1538 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 HYAL2Q12891 473 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 SPACA7Q96KW9 195 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 EHHADHQ08426 723 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 XKR5Q6UX68 686 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 PLD4Q96BZ4 506 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 KRBA1A5PL33 1030 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 FAM229AH3BQW9 127 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TTC9Q92623 222 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CES1P23141 567 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 MSL1Q68DK7 614 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CNTN3Q9P232 1028 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFB5O43674 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP4P98171 946 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 GRIK5Q16478 980 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 GJD3Q8N144 294 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 KIF4AO95239 1232 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 RAC1P63000 192 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 ECM1Q16610 540 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 PHACTR2O75167 634 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF21O75509 655 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 ATP11AP98196 1134 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 PMEPA1Q969W9 287 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0A0MRY4 1105 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 APBA3O96018 575 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CEP135Q66GS9 1140 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-214ENST00000530727 CHRDQ9H2X0 955 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 IGHA1P01876 353 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-214ENST00000530727 KCNA1Q09470 495 aa6.51□□□□□ -1.37
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