RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529566.1

TSPAN4-218, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-218ENST00000529566 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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TSPAN4-218ENST00000529566 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-218ENST00000529566 C6orf229H3BNL8 230 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-218ENST00000529566 NIM1KQ8IY84 436 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-218ENST00000529566 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-218ENST00000529566 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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TSPAN4-218ENST00000529566 GPC2Q8N158 579 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPAN4-218ENST00000529566 EYA3Q99504 573 aa20.28■□□□□ 0.84
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TSPAN4-218ENST00000529566 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.25■□□□□ 0.83
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TSPAN4-218ENST00000529566 ECE2O60344 883 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPAN4-218ENST00000529566 RAD17O75943 681 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPAN4-218ENST00000529566 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.23■□□□□ 0.83
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TSPAN4-218ENST00000529566 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.23■□□□□ 0.83
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TSPAN4-218ENST00000529566 MED23Q9ULK4 1368 aa20.21■□□□□ 0.83
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TSPAN4-218ENST00000529566 HACL1Q9UJ83 578 aa20.21■□□□□ 0.83
TSPAN4-218ENST00000529566 SCN4AP35499 1836 aa20.2■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 TNIP1Q15025 636 aa20.2■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 LRRC24Q50LG9 513 aa20.2■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.2■□□□□ 0.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 A0A1B0GUL6 1792 aa20.18■□□□□ 0.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 POTEJP0CG39 1038 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 EPHX2P34913 555 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 EPS15P42566 896 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 PODNQ7Z5L7 613 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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TSPAN4-218ENST00000529566 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 PANK1Q8TE04 598 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 PLIN1O60240 522 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 GNAI2P04899 355 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 KCNJ4P48050 445 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 FSTL1Q12841 308 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN4-218ENST00000529566 COA1Q9GZY4 146 aa20.16■□□□□ 0.82
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