RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 GSX2Q9BZM3 304 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 IGFLR1Q9H665 355 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PRXQ9BXM0 1461 aa6.89□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 DISP1Q96F81 1524 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 LGR5O75473 907 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ELNP15502 786 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 SELPP16109 830 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 DPYDQ12882 1025 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 RTN1Q16799 776 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT8Q8WV74 236 aa6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 SCNN1AP37088 669 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 CCINQ13939 588 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 MBTPS1Q14703 1052 aa6.87□□□□□ -1.31
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HDAC2-216ENST00000523628 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PNMA5Q96PV4 448 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ASXL2Q76L83 1435 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 IGFBP4P22692 258 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 RAC1P63000 192 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ILDR2Q71H61 639 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 HINFPQ9BQA5 517 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 BCS1LQ9Y276 419 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 USTQ9Y2C2 406 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 NFKB1P19838 968 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 NAGPAQ9UK23 515 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA8O94911 1581 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 EPB42P16452 691 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 PCSK7Q16549 785 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC2-216ENST00000523628 KIF21BO75037 1637 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD9Q5K651 1589 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ARTNQ5T4W7 220 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 INPP5BP32019 993 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 IDH3AP50213 366 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 OCLNQ16625 522 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 MSL1Q68DK7 614 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FAM35AQ86V20 835 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K6O95382 1288 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 SSFA2P28290 1259 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 KLK14Q9P0G3 267 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ZFATQ9P243 1243 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 USP21Q9UK80 565 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 NEO1Q92859 1461 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 CPB1P15086 417 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ARSDP51689 593 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 DGKZQ13574 1117 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 GRIK5Q16478 980 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 FMN1Q68DA7 1419 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 TP53INP1Q96A56 240 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.79□□□□□ -1.32
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