RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 FAM212AQ96EL1 285 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 MST1RQ04912 1400 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ALS2Q96Q42 1657 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 KIF3CO14782 793 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 IVLP07476 585 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PROSER3Q2NL68 480 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 BEND3Q5T5X7 828 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 JMYQ8N9B5 988 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 SRGAP3O43295 1099 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF592Q92610 1267 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 AK7Q96M32 723 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ELP1O95163 1332 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ADCY9O60503 1353 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 RPS6KA5O75582 802 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CORO7P57737 925 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 MAP9Q49MG5 647 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF11Q86T75 865 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 SSH3Q8TE77 659 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ERC2O15083 957 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 RILPL2Q969X0 211 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL33A6NCF5 533 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CUL4AQ13619 759 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 PTPN14Q15678 1187 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 KCND1Q9NSA2 647 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CLSTN1O94985 981 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 HSPA2P54652 639 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 SLC39A6Q13433 755 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CHRNA2Q15822 529 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC93Q567U6 631 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 USP27XA6NNY8 438 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2HP62256 183 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 POLA2Q14181 598 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TMX3Q96JJ7 454 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R5AQ15172 486 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 BORCS6Q96GS4 357 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 MEGF6O75095 1541 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 C21orf2O43822 256 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D8O95759 1140 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 INHBEP58166 350 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF790Q6PG37 636 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 KSR2Q6VAB6 950 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-209ENST00000519674 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms