RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 ORC1Q13415 861 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 TTC16Q8NEE8 873 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 J3QW42 95 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 EREGO14944 169 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHACTR2O75167 634 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACPPP15309 386 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIK1P57059 783 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCSK7Q16549 785 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASB16Q96NS5 453 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 TREHO43280 583 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 CES1P23141 567 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP11AP98196 1134 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 HYAL2Q12891 473 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 DSC3Q14574 896 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRIK5Q16478 980 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMC1Q8TDI8 760 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 RRAGCQ9HB90 399 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NID1P14543 1247 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CEP120Q8N960 986 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NUDT8Q8WV74 236 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM11Q96F44 468 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLD4Q96BZ4 506 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NFKBIEO00221 500 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 LILRB5O75023 590 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 GHRHP01286 108 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ILDR2Q71H61 639 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 TTC9Q92623 222 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PMEPA1Q969W9 287 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 HHIPQ96QV1 700 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CSRNP1Q96S65 589 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 GNB5O14775 395 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 GSK3AP49840 483 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC27Q2M243 656 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PODNQ7Z5L7 613 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PBX4Q9BYU1 374 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NPHS2Q9NP85 383 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRPA1O75762 1119 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 EDN3P14138 238 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 COL8A1P27658 744 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRS1P35568 1242 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 BAG6P46379 1132 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPACA7Q96KW9 195 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 RBSNQ9H1K0 784 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 NEFLP07196 543 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CEP135Q66GS9 1140 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 SETDB2Q96T68 719 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.5 ms