RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516568.1

RNU6-504P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 504, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-504P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-504P-201ENST00000516568 J3QW42 95 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 DLL1O00548 723 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 RARAP10276 462 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 EPB42P16452 691 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 NRLP54845 237 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PCSK7Q16549 785 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 OCLNQ16625 522 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 USP21Q9UK80 565 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TM4SF5O14894 197 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 MMP20O60882 483 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 XYLBO75191 536 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ALX3O95076 343 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SIK1P57059 783 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TREML1Q86YW5 311 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 WFDC8Q8IUA0 241 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PRIMPOLQ96LW4 560 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TNFRSF10BO14763 440 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SETDB1Q15047 1291 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PLD4Q96BZ4 506 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 F8W735 103 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZBTB39O15060 712 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PRMT3O60678 531 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 RFX1P22670 979 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 IL22RA1Q8N6P7 574 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PCMTD2Q9NV79 361 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SLAIN2Q9P270 581 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SOX18P35713 384 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 Q6ZS46 218 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 NLRP13Q86W25 1043 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 GALNT11Q8NCW6 608 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 STK32AQ8WU08 396 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 COL26A1Q96A83 441 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 VTI1AQ96AJ9 217 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 RNF112Q9ULX5 631 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 MED26O95402 600 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 PSAPP07602 524 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 BRD2P25440 801 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 OGFOD2Q6N063 350 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 C16orf46Q6P387 395 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 LILRA6Q6PI73 481 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 OR13H1Q8NG92 308 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 UBAP1LF5GYI3 381 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 LINC01387J3KSC0 135 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 WISP1O95388 367 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 GHRHP01286 108 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 FSTP19883 344 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 ATP11AP98196 1134 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZAP70P43403 619 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 SLC51AQ86UW1 340 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 CEP120Q8N960 986 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-504P-201ENST00000516568 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms