RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.41□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 STK17AQ9UEE5 414 aa10.41□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIK3C2AO00443 1686 aa10.41□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 GRM5P41594 1212 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 VEGFBP49765 207 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMF1P82094 1093 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIM2Q9P1W9 311 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.4□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 PALLDQ8WX93 1383 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SSFA2P28290 1259 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 IRF7Q92985 503 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 ITPKCQ96DU7 683 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.38□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 NR3C2P08235 984 aa10.38□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.38□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.38□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.37□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.37□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.37□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 NSD2O96028 1365 aa10.37□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 LY75O60449 1722 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXN1O15353 648 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 RFC4P35249 363 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.36□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 NFAT5O94916 1531 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOBPA7XYQ1 873 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC24A1O60721 1099 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 UPP2O95045 317 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 GMPRP36959 345 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 COG3Q96JB2 828 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 DOT1LQ8TEK3 1739 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 H3BM21 787 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 FSHRP23945 695 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 SIK1P57059 783 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.34□□□□□ -0.75
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAN1A2O60476 641 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 BMP2P12643 396 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 HOXC9P31274 260 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 LBX1P52954 281 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIGBQ92521 554 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABHD8Q96I13 439 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF4Q96M43 638 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 USP31Q70CQ4 1352 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 C5P01031 1676 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 LTN1O94822 1766 aa10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 GLTPD2A6NH11 291 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBLN1P23142 703 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.32□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 LMNB1P20700 586 aa10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 DCAF5Q96JK2 942 aa10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.31□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 C4BP0C0L5 1744 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNA3P22001 575 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHRNA5P30532 468 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 ERBB4Q15303 1308 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.3□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.29□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 RASSF7Q02833 373 aa10.29□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 ERFEQ4G0M1 354 aa10.29□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.29□□□□□ -0.76
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms