RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2R1	Q13018	1463 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	EXOC5	O00471	708 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	SLC27A2	O14975	620 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	BRD1	O95696	1058 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	AFM	P43652	599 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		9.29	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	DNA2	P51530	1060 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	CEP170	Q5SW79	1584 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GVL5	298 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	WTAP	Q15007	396 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	ODF2	Q5BJF6	829 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	IGSF3	O75054	1194 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	HSPA4	P34932	840 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	TBX22	Q9Y458	520 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	KCNQ3	O43525	872 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	RPS6KB1	P23443	525 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	SUCLG2	Q96I99	432 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	NBPF4	Q96M43	638 aa		9.28	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	SBNO1	A3KN83	1393 aa		9.27	□□□□□ -0.92
NEK1-208	ENST00000512193	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	TSPY2	A6NKD2	308 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	N4BP3	O15049	544 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	UBA7	P41226	1012 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF790	Q6PG37	636 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	IFNK	Q9P0W0	207 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SPA17	Q15506	151 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		9.27	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	IDE	P14735	1019 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CYP7A1	P22680	504 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	RTN1	Q16799	776 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SYCP1	Q15431	976 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB9	Q96C00	473 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ORAI2	Q96SN7	254 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	JAK2	O60674	1132 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	PIP4K2B	P78356	416 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	TNNI3K	Q59H18	835 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SSH3	Q8TE77	659 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0232	Q92628	1395 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	GBP3	Q9H0R5	595 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		9.26	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	YEATS4	O95619	227 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	FAM89A	Q96GI7	184 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ZPR1	O75312	459 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	PTH1R	Q03431	593 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL34	Q8N239	644 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	STX8	Q9UNK0	236 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GUL7	405 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	TAF3	Q5VWG9	929 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	GPT2	Q8TD30	523 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF5	Q96JK2	942 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	AOX1	Q06278	1338 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB7	P09629	217 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	STX17	P56962	302 aa		9.25	□□□□□ -0.93
NEK1-208	ENST00000512193	ME3	Q16798	604 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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