RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507686.1

TNIP2-205, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, human

TSL 4

Gene TNIP2, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNIP2-205	ENST00000507686	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	COL4A5	P29400	1685 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	UFL1	O94874	794 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	KLRK1	P26718	216 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	XDH	P47989	1333 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	CHRND	Q07001	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	MTX1	Q13505	466 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	TAF5L	O75529	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	MS4A1	P11836	297 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP2-205	ENST00000507686	LAMB2	P55268	1798 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	FZD9	O00144	591 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	EYA2	O00167	538 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	EYA3	Q99504	573 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	SIL1	Q9H173	461 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	POLA2	Q14181	598 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	CIAO1	O76071	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	POTEC	B2RU33	542 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	ECE2	O60344	883 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	RAD17	O75943	681 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	PDE8B	O95263	885 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	KCNJ4	P48050	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	CXCL9	Q07325	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	FGFR2	P21802	821 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNIP2-205	ENST00000507686	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	KIF3C	O14782	793 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	TFCP2	Q12800	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	GPC2	Q8N158	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	TAF1	P21675	1872 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNIP2-205	ENST00000507686	PSMD14	O00487	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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