RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP2B4P23634 1241 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM161AQ3B820 660 aa26.59■■□□□ 1.85
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SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA6P17066 643 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.58■■□□□ 1.85
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SH3BP2-210ENST00000505941 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 RAD17O75943 681 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 COL4A5P29400 1685 aa26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP2-210ENST00000505941 CHADLQ6NUI6 762 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 LDHDQ86WU2 507 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-210ENST00000505941 COL4A1P02462 1669 aa26.51■■□□□ 1.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 SUCLG2Q96I99 432 aa26.51■■□□□ 1.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-210ENST00000505941 USP44Q9H0E7 712 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-210ENST00000505941 YDJCA8MPS7 323 aa26.48■■□□□ 1.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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SH3BP2-210ENST00000505941 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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SH3BP2-210ENST00000505941 FBXW7Q969H0 707 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM27P14373 513 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.36■■□□□ 1.81
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