RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503219.5

SH3BP2-206, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-206ENST00000503219 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 PCNTO95613 3336 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 PSMD14O00487 310 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 ECE2O60344 883 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 UFL1O94874 794 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 BEND3Q5T5X7 828 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 LINS1Q8NG48 757 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 TRAF5O00463 557 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 EGFRP00533 1210 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 FAM161AQ3B820 660 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 CREBZFQ9NS37 354 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 DLK2Q6UY11 383 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 GGA1Q9UJY5 639 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-206ENST00000503219 ITGA6P23229 1130 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 FOXO4P98177 505 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 TNIP1Q15025 636 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 MICALL2Q8IY33 904 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 EYA3Q99504 573 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 CSF1RP07333 972 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 KLRK1P26718 216 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 SLFN5Q08AF3 891 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 A0A1B0GUL6 1792 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 XDHP47989 1333 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 PSME4Q14997 1843 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 SNAP23O00161 211 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 CST9Q5W186 159 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 CNTNAP1P78357 1384 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 ATP2B4P23634 1241 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 MXD3Q9BW11 206 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 VEGFBP49765 207 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-206ENST00000503219 E9PSI1 815 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 GRM8O00222 908 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 KAZALD1Q96I82 304 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 G3V3G9 751 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 CCER2I3L3R5 266 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 DPF2Q92785 391 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 SUCLG2Q96I99 432 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 H7C1D1 291 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 TAF5LO75529 589 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 CHRNDQ07001 517 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 MED23Q9ULK4 1368 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 USP48Q86UV5 1035 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 RASSF10A6NK89 507 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ADM5C9JUS6 153 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ALDH1L1O75891 902 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 GMLQ99445 158 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms