RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492959.1

GTF2E1-204, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene GTF2E1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-204ENST00000492959 RIMBP2O15034 1052 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 GPSM2P81274 684 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 NOGQ13253 232 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 MBIPQ9NS73 344 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 POLLQ9UGP5 575 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2E1-204ENST00000492959 SHTN1A0MZ66 631 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 ECE2O60344 883 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 USP48Q86UV5 1035 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 G3V3G9 751 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 HUNKP57058 714 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 GNAI1P63096 354 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 IFT57Q9NWB7 429 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 TSKSQ9UJT2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF853P0CG23 659 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 DOK7Q18PE1 504 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 UFL1O94874 794 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 MYD88Q99836 296 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 GGA1Q9UJY5 639 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 RTL9Q8NET4 1388 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 APAF1O14727 1248 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 PDE8AO60658 829 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 SULF1Q8IWU6 871 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC102AQ96A19 550 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 COL4A1P02462 1669 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 EGFRP00533 1210 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 RGMBQ6NW40 437 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2E1-204ENST00000492959 SCN9AQ15858 1988 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ADM5C9JUS6 153 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 FAM161AQ3B820 660 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 GGA3Q9NZ52 723 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF609O15014 1411 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 XDHP47989 1333 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 DLK2Q6UY11 383 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ATP2B4P23634 1241 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 RGS19P49795 217 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ZIC5Q96T25 663 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 PSME4Q14997 1843 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 USP17L8P0C7I0 530 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 DGKZQ13574 1117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 PODNQ7Z5L7 613 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 USP17L3A6NCW0 530 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 USP17L4A6NCW7 530 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 CTSWP56202 376 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 FKBP1BP68106 108 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 SCARF1Q14162 830 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 KSR2Q6VAB6 950 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 CDCA5Q96FF9 252 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 STK31Q9BXU1 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms