RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 SIK1P57059 783 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 PDE4CQ08493 712 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 EDEM1Q92611 657 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 J3QW42 95 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM13AO94988 1023 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 IGHA1P01876 353 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 NPR3P17342 541 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 SOX18P35713 384 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 WIZO95785 1651 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 PCSK2P16519 638 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 AAMPQ13685 434 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC16Q8NEE8 873 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 OR13H1Q8NG92 308 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC9Q92623 222 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 ELP3Q9H9T3 547 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-211ENST00000492895 CFTRP13569 1480 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM229AH3BQW9 127 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 MSTNO14793 375 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GHRHP01286 108 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 PDGFAP04085 211 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIK5Q16478 980 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 PLD4Q96BZ4 506 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 RBSNQ9H1K0 784 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF11O15085 1522 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0A0MRY4 1105 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 HYAL2Q12891 473 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 C8orf34Q49A92 452 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 MSL1Q68DK7 614 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 XKR5Q6UX68 686 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ILDR2Q71H61 639 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CD163Q86VB7 1156 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 POLIQ9UNA4 740 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 A6NHS1 94 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ICMTO60725 284 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 PROCP04070 461 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CHRNA4P43681 627 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 SERPINB4P48594 390 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 RAC1P63000 192 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 SPACA7Q96KW9 195 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CNTN3Q9P232 1028 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 WDR62O43379 1518 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 FZD6O60353 706 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 APBA3O96018 575 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 USP5P45974 858 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIK4Q16099 956 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 H3BRB1 525 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF4AO95239 1232 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ELNP15502 786 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 NACC1Q96RE7 527 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 CES1P23141 567 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 BAG6P46379 1132 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP11AP98196 1134 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms