RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492601.2

SGMS1-204, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-204ENST00000492601 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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SGMS1-204ENST00000492601 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 PSMD14O00487 310 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 ECE2O60344 883 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 UFL1O94874 794 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 CTSWP56202 376 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 FLIIQ13045 1269 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 VAMP4O75379 141 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 MICALL2Q8IY33 904 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 GGA1Q9UJY5 639 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 RASSF10A6NK89 507 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 H7C1D1 291 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 RTL9Q8NET4 1388 aa22.08■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 G3V3G9 751 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.07■■□□□ 1.12
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SGMS1-204ENST00000492601 GREM2Q9H772 168 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 H7C1W4 665 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 CST9Q5W186 159 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 XDHP47989 1333 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 GCKRQ14397 625 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 DPF2Q92785 391 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 FOXN1O15353 648 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 EGFRP00533 1210 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 GRM1Q13255 1194 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 TNS4Q8IZW8 715 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 LINS1Q8NG48 757 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-204ENST00000492601 F6X3S4 739 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 ATP2B4P23634 1241 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CASP7P55210 303 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 AIDAQ96BJ3 306 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CAPNS2Q96L46 248 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.01■■□□□ 1.11
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SGMS1-204ENST00000492601 FAM161AQ3B820 660 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CYP4F22Q6NT55 531 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 USP48Q86UV5 1035 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 DLK2Q6UY11 383 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 WBP1LQ9NX94 342 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 A0A1B0GUL6 1792 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 ITGA6P23229 1130 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 ECE1P42892 770 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 MED23Q9ULK4 1368 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CAPN15O75808 1086 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CSF1RP07333 972 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 BEND3Q5T5X7 828 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-204ENST00000492601 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 USP17L3A6NCW0 530 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 USP17L4A6NCW7 530 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 ADM5C9JUS6 153 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 PODNQ7Z5L7 613 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 AOC2O75106 756 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-204ENST00000492601 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.93■■□□□ 1.1
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