RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMBP2O15034 1052 aa30.08■■■□□ 2.41
CTDSP1-211ENST00000492545 UFL1O94874 794 aa30.08■■■□□ 2.41
CTDSP1-211ENST00000492545 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CTDSP1-211ENST00000492545 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.08■■■□□ 2.41
CTDSP1-211ENST00000492545 CSF1RP07333 972 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP2B4P23634 1241 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 SLFN5Q08AF3 891 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 JMYQ8N9B5 988 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 F6X3S4 739 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 COL4A1P02462 1669 aa30.06■■■□□ 2.4
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CTDSP1-211ENST00000492545 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDSP1-211ENST00000492545 G3V3G9 751 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 ECE2O60344 883 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 ALDH1L1O75891 902 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.04■■■□□ 2.4
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CTDSP1-211ENST00000492545 H7C1D1 291 aa30.02■■■□□ 2.4
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CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 GRM8O00222 908 aa30.01■■■□□ 2.39
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CTDSP1-211ENST00000492545 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM161AQ3B820 660 aa29.99■■■□□ 2.39
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CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRCP08575 1304 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 PODNQ7Z5L7 613 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.98■■■□□ 2.39
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CTDSP1-211ENST00000492545 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXO4P98177 505 aa29.97■■■□□ 2.39
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CTDSP1-211ENST00000492545 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 MICALL2Q8IY33 904 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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CTDSP1-211ENST00000492545 MED23Q9ULK4 1368 aa29.94■■■□□ 2.38
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CTDSP1-211ENST00000492545 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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CTDSP1-211ENST00000492545 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.91■■■□□ 2.38
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CTDSP1-211ENST00000492545 CNTNAP1P78357 1384 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 COA1Q9GZY4 146 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 UTYO14607 1347 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 PCNTO95613 3336 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF609O15014 1411 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 USP17L3A6NCW0 530 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 USP17L4A6NCW7 530 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRNDQ07001 517 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 RASSF10A6NK89 507 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNJ4P48050 445 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 SHTN1A0MZ66 631 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDSP1-211ENST00000492545 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.85■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
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CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 MMP14P50281 582 aa29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 GMLQ99445 158 aa29.84■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 CST9Q5W186 159 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 SCN9AQ15858 1988 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.82■■■□□ 2.36
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