RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 RTL9Q8NET4 1388 aa27.16■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 SULF1Q8IWU6 871 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 TRPA1O75762 1119 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 RNF186Q9NXI6 227 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-210ENST00000491139 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 HOXB7P09629 217 aa27.12■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 GGA3Q9NZ52 723 aa27.12■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 G3V3G9 751 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 SLC10A3P09131 477 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 HYPKQ9NX55 129 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 RALBP1Q15311 655 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 COL4A1P02462 1669 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 CDCA5Q96FF9 252 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 CSRNP1Q96S65 589 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.08■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NELFE-210ENST00000491139 SCN9AQ15858 1988 aa27.08■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 UFL1O94874 794 aa27.07■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.07■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 SOX10P56693 466 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 GGA1Q9UJY5 639 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 SCARF1Q14162 830 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 AGBL3Q8NEM8 1001 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.04■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 RUNDC1Q96C34 613 aa27.04■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 FKBP1BP68106 108 aa27.03■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 GOLGA2Q08379 1002 aa27.02■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 RASAL3Q86YV0 1011 aa27.02■■□□□ 1.92
NELFE-210ENST00000491139 ZNF609O15014 1411 aa27.01■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.01■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 USP17L8P0C7I0 530 aa27■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.99■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 XDHP47989 1333 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 GMLQ99445 158 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 MYD88Q99836 296 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PDE8AO60658 829 aa26.97■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.97■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 MBIPQ9NS73 344 aa26.97■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.97■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 USP17L3A6NCW0 530 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 USP17L4A6NCW7 530 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 PODNQ7Z5L7 613 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
NELFE-210ENST00000491139 ATP2B4P23634 1241 aa26.95■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.95■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 PSME4Q14997 1843 aa26.95■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 MOB2Q70IA6 237 aa26.94■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.94■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.93■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.92■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D8O95759 1140 aa26.91■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 ZNF853P0CG23 659 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 OGFOD1Q8N543 542 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NELFE-210ENST00000491139 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
NELFE-210ENST00000491139 NF2P35240 595 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-210ENST00000491139 TM4SF4P48230 202 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-210ENST00000491139 IFT57Q9NWB7 429 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-210ENST00000491139 MED23Q9ULK4 1368 aa26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.3 ms