RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 SNRKQ9NRH2 765 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 FOXO3O43524 673 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 GNRH1P01148 92 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 C8orf37Q96NL8 207 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 PRAM1Q96QH2 718 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 SBNO1A3KN83 1393 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 USP54Q70EL1 1684 aa8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 CNKSR1Q969H4 720 aa8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 PIK3C2AO00443 1686 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 F11P03951 625 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 BCRP11274 1271 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 MX2P20592 715 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 RXRBP28702 533 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 COL18A1P39060 1754 aa8.53□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 IL2RAP01589 272 aa8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 ACDQ96AP0 544 aa8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 RGPD5Q99666 1765 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHA1P01876 353 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 FOXK2Q01167 660 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CENPCQ03188 943 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.51□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 NGLY1Q96IV0 654 aa8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 GPAMQ9HCL2 828 aa8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 USP21Q9UK80 565 aa8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.5□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PHKA2P46019 1235 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PODNQ7Z5L7 613 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 SBF2Q86WG5 1849 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 RREB1Q92766 1687 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 SLIT3O75094 1523 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PEAK1Q9H792 1746 aa8.49□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 ARHGEF10O15013 1369 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1B0GTH6 734 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 THBS1P07996 1170 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 FGD1P98174 961 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 GNASQ5JWF2 1037 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 XAGE2Q96GT9 111 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.48□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 SSH2Q76I76 1423 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC37A3O60309 1634 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.47□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.46□□□□□ -1.05
JMJD1C-208ENST00000490669 OIP5O43482 229 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP2K3P46734 347 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 PHF24Q9UPV7 400 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.46□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 LTN1O94822 1766 aa8.45□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 LRP5O75197 1615 aa8.45□□□□□ -1.06
JMJD1C-208ENST00000490669 USP4Q13107 963 aa8.45□□□□□ -1.06
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