RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	NR5A1	Q13285	461 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CLN3	Q13286	438 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ORC1	Q13415	861 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74	7e-7	■■□□□ 12.4
UBXN4-208	ENST00000490163	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZAP70	P43403	619 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GNAL	P38405	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TESK1	Q15569	626 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NINJ1	Q92982	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MDFI	Q99750	246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TM4SF5	O14894	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	KIF3B	O15066	747 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GSTT1	P30711	240 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FZD9	O00144	591 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ADCY3	O60266	1144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CILP	O75339	1184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	STAT3	P40763	770 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MICAL2	O94851	1124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EPHB1	P54762	984 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SELP	P16109	830 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CTH	P32929	405 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RHBDL3	P58872	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EPN3	Q9H201	632 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NFKBIE	O00221	500 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TSC1	Q92574	1164 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TYRP1	P17643	537 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	HIF1A	Q16665	826 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	BMP6	P22004	513 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MCL1	Q07820	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ADH1C	P00326	375 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CDC45	O75419	566 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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