RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 SOX11P35716 441 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 MEIOBQ8N635 442 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.19□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.18□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.18□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 RTL1A6NKG5 1358 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 ARHGEF10O15013 1369 aa7.18□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 PIK3C2AO00443 1686 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 NFE2L2Q16236 605 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4A-208ENST00000489247 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 ZNF428Q96B54 188 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 FLT4P35916 1363 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4A-208ENST00000489247 ADAM23O75077 832 aa7.14□□□□□ -1.27
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ATG4A-208ENST00000489247 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.14□□□□□ -1.27
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ATG4A-208ENST00000489247 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 IFT57Q9NWB7 429 aa7.14□□□□□ -1.27
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ATG4A-208ENST00000489247 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 NCAPD2Q15021 1401 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 USP19O94966 1318 aa7.13□□□□□ -1.27
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ATG4A-208ENST00000489247 SOBPA7XYQ1 873 aa7.13□□□□□ -1.27
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ATG4A-208ENST00000489247 FOXK2Q01167 660 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 KIF1AQ12756 1690 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG4A-208ENST00000489247 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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