RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.43■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.43■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.43■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.43■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 BBOX1O75936 387 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 KCNA3P22001 575 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 NUCB1Q02818 461 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 TFCP2Q12800 502 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 METTL24Q5JXM2 366 aa20.41■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 SLC51AQ86UW1 340 aa20.41■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 LNPKQ9C0E8 428 aa20.41■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.41■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 CHRNDQ07001 517 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 CNKSR1Q969H4 720 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.4■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
THBS3-207ENST00000486260 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.39■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 CACNA1SQ13698 1873 aa20.39■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.38■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 PDE8BO95263 885 aa20.37■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 TMC4Q7Z404 712 aa20.37■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 TTLL6Q8N841 843 aa20.37■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.37■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 SLX4Q8IY92 1834 aa20.37■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.36■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 TNNI3KQ59H18 835 aa20.36■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 OLFM4Q6UX06 510 aa20.36■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.36■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.36■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 SNAP23O00161 211 aa20.35■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 PDE4AP27815 886 aa20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 TIMM10P62072 90 aa20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 AACSQ86V21 672 aa20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 GPR108Q9NPR9 543 aa20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.34■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 GPSM2P81274 684 aa20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
THBS3-207ENST00000486260 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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THBS3-207ENST00000486260 A0A1B0GUL7 405 aa20.33■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 ATP2B3Q16720 1220 aa20.33■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.33■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.33■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 ZNF609O15014 1411 aa20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 C21orf2O43822 256 aa20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 SYT17Q9BSW7 474 aa20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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THBS3-207ENST00000486260 FGFR2P21802 821 aa20.31■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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THBS3-207ENST00000486260 UBE4AQ14139 1066 aa20.3■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 LPIN2Q92539 896 aa20.3■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.3■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.3■□□□□ 0.84
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THBS3-207ENST00000486260 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 ADORA1P30542 326 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 MPNDQ8N594 471 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 SLC5A1P13866 664 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 XAGE2Q96GT9 111 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 GGA1Q9UJY5 639 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 BCS1LQ9Y276 419 aa20.29■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 UFL1O94874 794 aa20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 ATP2B4P23634 1241 aa20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.28■□□□□ 0.84
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