RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 SPEF2Q9C093 1822 aa28.32■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.32■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 C21orf2O43822 256 aa28.31■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 CIAO1O76071 339 aa28.31■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 POLA2Q14181 598 aa28.31■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.31■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.3■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 EYA2O00167 538 aa28.3■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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NBPF3-212ENST00000486229 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.3■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.29■■■□□ 2.12
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NBPF3-212ENST00000486229 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 MPNDQ8N594 471 aa28.28■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.28■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 XDHP47989 1333 aa28.27■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.27■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.27■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.27■■■□□ 2.12
NBPF3-212ENST00000486229 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.26■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.26■■■□□ 2.11
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NBPF3-212ENST00000486229 METTL24Q5JXM2 366 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 PSMD1Q99460 953 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 SIL1Q9H173 461 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 VPS33BQ9H267 617 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.24■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 KCNJ4P48050 445 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 EYA3Q99504 573 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 GGA1Q9UJY5 639 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.23■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.22■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.22■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 RAB11FIP3O75154 756 aa28.21■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 APLP1P51693 650 aa28.21■■■□□ 2.11
NBPF3-212ENST00000486229 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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NBPF3-212ENST00000486229 LRRC24Q50LG9 513 aa28.2■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.2■■■□□ 2.1
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NBPF3-212ENST00000486229 COL4A1P02462 1669 aa28.19■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 C6orf229H3BNL8 230 aa28.18■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 UFL1O94874 794 aa28.18■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 PDE8BO95263 885 aa28.18■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 UBE4AQ14139 1066 aa28.18■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.18■■■□□ 2.1
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NBPF3-212ENST00000486229 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.17■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 A0A1B0GUL6 1792 aa28.16■■■□□ 2.1
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NBPF3-212ENST00000486229 TOMM70O94826 608 aa28.15■■■□□ 2.1
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NBPF3-212ENST00000486229 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 SNED1Q8TER0 1413 aa28.15■■■□□ 2.1
NBPF3-212ENST00000486229 LTBP1Q14766 1721 aa28.15■■■□□ 2.1
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NBPF3-212ENST00000486229 WDR90Q96KV7 1748 aa28.13■■■□□ 2.09
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NBPF3-212ENST00000486229 MED23Q9ULK4 1368 aa28.12■■■□□ 2.09
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NBPF3-212ENST00000486229 TAF5LO75529 589 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 LMNB1P20700 586 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 POLLQ9UGP5 575 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 PCNTO95613 3336 aa28.12■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 ATP2B3Q16720 1220 aa28.11■■■□□ 2.09
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