RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 PLD4Q96BZ4 506 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 SPACA7Q96KW9 195 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGB2P05107 769 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRNA4P43681 627 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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RABGGTB-210ENST00000485459 ELP3Q9H9T3 547 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0A0MRY4 1105 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-210ENST00000485459 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 HYAL2Q12891 473 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 MSL1Q68DK7 614 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 OR13H1Q8NG92 308 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 NACC1Q96RE7 527 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 PROCP04070 461 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 PDGFAP04085 211 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 GRIK4Q16099 956 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 ELNP15502 786 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 POLIQ9UNA4 740 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 A6NHS1 94 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 H3BRB1 525 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 USP5P45974 858 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINB4P48594 390 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGGTB-210ENST00000485459 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.118e-15■■■■□ 24
RABGGTB-210ENST00000485459 NPR3P17342 541 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 CES1P23141 567 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 GATA4P43694 442 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 BAG6P46379 1132 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP135Q66GS9 1140 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-210ENST00000485459 USP21Q9UK80 565 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGGTB-210ENST00000485459 FAM177BA6PVY3 158 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 C9orf172C9J069 976 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP11AP98196 1134 aa8.08□□□□□ -1.12
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RABGGTB-210ENST00000485459 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 FURINP09958 794 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 SELPP16109 830 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 DOC2BQ14184 412 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 PBX4Q9BYU1 374 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC3BQ9H195 1237 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 PPME1Q9Y570 386 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF21O75509 655 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-210ENST00000485459 CEP120Q8N960 986 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-210ENST00000485459 CDC27P30260 824 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 MBTPS1Q14703 1052 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-210ENST00000485459 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 GJD3Q8N144 294 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 TMC1Q8TDI8 760 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRDQ9H2X0 955 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01387J3KSC0 135 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-210ENST00000485459 EREGO14944 169 aa8.01□□□□□ -1.13
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