RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 XDHP47989 1333 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 GGA1Q9UJY5 639 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 RIMBP2O15034 1052 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 GPC2Q8N158 579 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 EYA3Q99504 573 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 UFL1O94874 794 aa26.39■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ACTB-211ENST00000480301 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 TRIM27P14373 513 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ATP2B4P23634 1241 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 TNNQ9UQP3 1299 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 YDJCA8MPS7 323 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 CXCL9Q07325 125 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 DOK7Q18PE1 504 aa26.35■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 CHRNDQ07001 517 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 SPEF2Q9C093 1822 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ECE2O60344 883 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 HACL1Q9UJ83 578 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-211ENST00000480301 RAD17O75943 681 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 SCNN1DP51172 638 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 MEIS3Q99687 375 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 TNIP1Q15025 636 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 MED23Q9ULK4 1368 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 SCN4AP35499 1836 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 TAF5LO75529 589 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 POTEIP0CG38 1075 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 POTEJP0CG39 1038 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 EPHX2P34913 555 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 EPS15P42566 896 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 FSTL1Q12841 308 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 SNAP23O00161 211 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 PSMD14O00487 310 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACTB-211ENST00000480301 G3V3G9 751 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 KLRK1P26718 216 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 GNAI3P08754 354 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ4P48050 445 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 LRRC24Q50LG9 513 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 PODNQ7Z5L7 613 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 PLIN1O60240 522 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 HSPA6P17066 643 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 COA1Q9GZY4 146 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 RLBP1P12271 317 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 CHADLQ6NUI6 762 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 LDHDQ86WU2 507 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 SCN9AQ15858 1988 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 DPF2Q92785 391 aa26.21■■□□□ 1.79
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