RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-208ENST00000479480 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-208ENST00000479480 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-208ENST00000479480 NUP98P52948 1817 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-208ENST00000479480 RGS19P49795 217 aa11.08□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 GRAPQ13588 217 aa11.08□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 TNIP1Q15025 636 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.08□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 CHL1O00533 1208 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 RIMBP2O15034 1052 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 EGFRP00533 1210 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 NEUROD2Q15784 382 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 POLLQ9UGP5 575 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 H7C1D1 291 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 PSMD14O00487 310 aa11.06□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 MICALL2Q8IY33 904 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.06□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 GPSM2P81274 684 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 DOK7Q18PE1 504 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 WASHC4Q2M389 1173 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 C6orf229H3BNL8 230 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 SLC34A2O95436 690 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 HUNKP57058 714 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 DPF2Q92785 391 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 TRPC6Q9Y210 931 aa11.04□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 DGKZQ13574 1117 aa11.03□□□□□ -0.64
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CTPS1-208ENST00000479480 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 RTL9Q8NET4 1388 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CA12O43570 354 aa11.02□□□□□ -0.65
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CTPS1-208ENST00000479480 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
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CTPS1-208ENST00000479480 EVX2Q03828 476 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 NOGQ13253 232 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TMC4Q7Z404 712 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.01□□□□□ -0.65
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CTPS1-208ENST00000479480 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 COL4A1P02462 1669 aa11.01□□□□□ -0.65
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CTPS1-208ENST00000479480 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RALBP1Q15311 655 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf69Q8N8R5 385 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 CSRNP1Q96S65 589 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RNF186Q9NXI6 227 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TRPA1O75762 1119 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RUNDC1Q96C34 613 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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