RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 SPEF2Q9C093 1822 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 ADORA1P30542 326 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 SEC24BO95487 1268 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GUL7 405 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 SDSP20132 328 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 BACH2Q9BYV9 841 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 STAP2Q9UGK3 403 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 RTL9Q8NET4 1388 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 CHRNDQ07001 517 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 PDE8BO95263 885 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 RILPL2Q969X0 211 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 CRY2Q49AN0 593 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 XAGE2Q96GT9 111 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO3Q9UK99 471 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 ATP2B3Q16720 1220 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF609O15014 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 OLFM4Q6UX06 510 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 CHRNA5P30532 468 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 GRAPQ13588 217 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 LRP5O75197 1615 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 GPR108Q9NPR9 543 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 KLRK1P26718 216 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 SRGNP10124 158 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 SCARF1Q14162 830 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 PI16Q6UXB8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 SNRKQ9NRH2 765 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-217ENST00000475693 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.08■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 FGFR2P21802 821 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GORABQ5T7V8 394 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 CHGBP05060 677 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.127e-6■□□□□ 9.9
ATG4B-217ENST00000475693 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GPATCH3Q96I76 525 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 PHKA1P46020 1223 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ERC2O15083 957 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 BCAMP50895 628 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 AOX1Q06278 1338 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ATP5JP18859 108 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 PDE6BP35913 854 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 LPIN2Q92539 896 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GYG1P46976 350 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC102BQ68D86 513 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 GPSM2P81274 684 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 IL25Q9H293 177 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-217ENST00000475693 CDC45O75419 566 aa22.02■■□□□ 1.11
ATG4B-217ENST00000475693 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
ATG4B-217ENST00000475693 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.02■■□□□ 1.11
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
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