RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 DPF2Q92785 391 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 COL4A1P02462 1669 aa24.81■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 G3V3G9 751 aa24.8■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.8■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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SHQ1-206ENST00000471526 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.78■■□□□ 1.56
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SHQ1-206ENST00000471526 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.78■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 USP48Q86UV5 1035 aa24.78■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.78■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.78■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 AOC2O75106 756 aa24.77■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 KSR2Q6VAB6 950 aa24.77■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.77■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 STK31Q9BXU1 1019 aa24.77■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 GGA1Q9UJY5 639 aa24.77■■□□□ 1.56
SHQ1-206ENST00000471526 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.76■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 WWC1Q8IX03 1113 aa24.76■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 RTL9Q8NET4 1388 aa24.76■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 EGFRP00533 1210 aa24.75■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 IGKV5-2P06315 115 aa24.74■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.74■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC27Q2M243 656 aa24.74■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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SHQ1-206ENST00000471526 MAP2K2P36507 400 aa24.73■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 SLC4A2P04920 1241 aa24.72■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 CTSWP56202 376 aa24.72■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 G2E3Q7L622 706 aa24.72■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.72■■□□□ 1.55
SHQ1-206ENST00000471526 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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SHQ1-206ENST00000471526 XDHP47989 1333 aa24.7■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.7■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.7■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 TSKSQ9UJT2 592 aa24.7■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.69■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 ADM5C9JUS6 153 aa24.69■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 ATP2B4P23634 1241 aa24.69■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 MRS2Q9HD23 443 aa24.69■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 HUNKP57058 714 aa24.68■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 GREM2Q9H772 168 aa24.68■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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SHQ1-206ENST00000471526 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.67■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 IL16Q14005 1332 aa24.66■■□□□ 1.54
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SHQ1-206ENST00000471526 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 GGA3Q9NZ52 723 aa24.66■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.66■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 H7C1W4 665 aa24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 FLIIQ13045 1269 aa24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 SULF1Q8IWU6 871 aa24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.65■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L3A6NCW0 530 aa24.64■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L4A6NCW7 530 aa24.64■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.64■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 PODNQ7Z5L7 613 aa24.64■■□□□ 1.54
SHQ1-206ENST00000471526 ANP32CO43423 234 aa24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 SCARF1Q14162 830 aa24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 ZIC5Q96T25 663 aa24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.63■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 NOGQ13253 232 aa24.62■■□□□ 1.53
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SHQ1-206ENST00000471526 RGMBQ6NW40 437 aa24.62■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 ABHD8Q96I13 439 aa24.62■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 CA12O43570 354 aa24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L8P0C7I0 530 aa24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 GMLQ99445 158 aa24.61■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 VAMP4O75379 141 aa24.6■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 FBXW7Q969H0 707 aa24.6■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.6■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 SCN9AQ15858 1988 aa24.6■■□□□ 1.53
SHQ1-206ENST00000471526 ITGA6P23229 1130 aa24.59■■□□□ 1.53
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