RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 TBCELQ5QJ74 424 aa5.09□□□□□ -1.59
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SHQ1-204ENST00000468347 MUC3BQ9H195 1237 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-204ENST00000468347 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-204ENST00000468347 EPHA4P54764 986 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-204ENST00000468347 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-204ENST00000468347 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-204ENST00000468347 TM4SF5O14894 197 aa5.07□□□□□ -1.6
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SHQ1-204ENST00000468347 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.96□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.96□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.96□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.95□□□□□ -1.62
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