RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 ITGA6P23229 1130 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 KRT32Q14532 448 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 CPA1P15085 419 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 MCTP1Q6DN14 999 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 SYNE4Q8N205 404 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 GREM2Q9H772 168 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 LRP5O75197 1615 aa22.47■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 VPS72Q15906 364 aa22.46■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.46■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 XAGE2Q96GT9 111 aa22.46■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.46■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.45■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ANKRD1Q15327 319 aa22.45■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.45■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ITPK1Q13572 414 aa22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 RPS6KB1P23443 525 aa22.44■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 PARP10Q53GL7 1025 aa22.44■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 A0A0G2JS52 829 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 CAMTA2O94983 1202 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 METTL24Q5JXM2 366 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 GORABQ5T7V8 394 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ADORA1P30542 326 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ATP2B3Q16720 1220 aa22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.42■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.42■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 LARGE1O95461 756 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 CHGBP05060 677 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 LAMB2P55268 1798 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 BCORQ6W2J9 1755 aa22.41■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 SUSD4Q5VX71 490 aa22.4■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 NGLY1Q96IV0 654 aa22.4■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.4■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 ME3Q16798 604 aa22.39■■□□□ 1.18
NME4-210ENST00000468031 KCNQ2O43526 872 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 PDE8BO95263 885 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 CYP21A2P08686 494 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 C8orf37Q96NL8 207 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 NEK1Q96PY6 1258 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MAST3O60307 1309 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 RTL9Q8NET4 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 RGL2O15211 777 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 STX6O43752 255 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 SYT1P21579 422 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MRE11P49959 708 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ST3GAL1Q11201 340 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MYH7P12883 1935 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 NTSR2O95665 410 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 GJB2P29033 226 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 SCARF1Q14162 830 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ZAP70P43403 619 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
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