RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	NIM1K	Q8IY84	436 aa		22.31	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	22.31	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	22.31	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	RIMBP2	O15034	1052 aa		22.3	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	22.3	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	KAZALD1	Q96I82	304 aa		22.3	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	POTEC	B2RU33	542 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	UFL1	O94874	794 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	APLP1	P51693	650 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	WASHC4	Q2M389	1173 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	VPS33B	Q9H267	617 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	POLL	Q9UGP5	575 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	GGA1	Q9UJY5	639 aa		22.29	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	EYA3	Q99504	573 aa		22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	XDH	P47989	1333 aa		22.28	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		22.27	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	COL4A5	P29400	1685 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902		G3V3G9	751 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	FZD9	O00144	591 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	LTBP1	Q14766	1721 aa		22.26	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ATP2B4	P23634	1241 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	MEIS3	Q99687	375 aa		22.25	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	22.24	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		22.24	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		22.24	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	GNAI3	P08754	354 aa		22.23	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ4	P48050	445 aa		22.23	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	DOK7	Q18PE1	504 aa		22.23	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	WDR90	Q96KV7	1748 aa		22.23	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	PLIN1	O60240	522 aa		22.22	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	CHRND	Q07001	517 aa		22.22	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		22.22	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		22.21	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	GPC2	Q8N158	579 aa		22.21	■■□□□ 1.15
USP19-210	ENST00000465902	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	TAF5L	O75529	589 aa		22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	RAD17	O75943	681 aa		22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		22.2	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	ECE2	O60344	883 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	RLBP1	P12271	317 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	CXCL9	Q07325	125 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GUL6	1792 aa		22.19	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	MS4A1	P11836	297 aa		22.18	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		22.18	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	PANK1	Q8TE04	598 aa		22.18	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	SCN4A	P35499	1836 aa		22.17	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		22.17	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	YDJC	A8MPS7	323 aa		22.17	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	GNAI2	P04899	355 aa		22.17	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	TNIP1	Q15025	636 aa		22.17	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	MED23	Q9ULK4	1368 aa		22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	SNAP23	O00161	211 aa		22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	LRRC24	Q50LG9	513 aa		22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	HACL1	Q9UJ83	578 aa		22.15	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	SCN9A	Q15858	1988 aa		22.14	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		22.14	■■□□□ 1.14
USP19-210	ENST00000465902	METTL24	Q5JXM2	366 aa		22.14	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	SIL1	Q9H173	461 aa		22.14	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		22.14	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		22.14	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	KLRK1	P26718	216 aa		22.13	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	HTRA3	P83110	453 aa		22.13	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		22.13	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	PSMD14	O00487	310 aa		22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	SRGAP3	O43295	1099 aa		22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13

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