RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 H3BQV1 296 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 JAK2O60674 1132 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K11Q16584 847 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 IFFO2Q5TF58 517 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 GLI3P10071 1580 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 A1BGP04217 495 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TIMM10P62072 90 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 BRF1Q92994 677 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 MPNDQ8N594 471 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 LIG1P18858 919 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 CAMK4Q16566 473 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 EYA2O00167 538 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TICAM2Q86XR7 235 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TNMDQ9H2S6 317 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 DACT1Q9NYF0 836 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 DDX11Q96FC9 970 aa21.64■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC24Q50LG9 513 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 SCRN1Q12765 414 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GUL7 405 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 BICD2Q8TD16 824 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ATG3Q9NT62 314 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 CIAO1O76071 339 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 IL2RBP14784 551 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 TYRO3Q06418 890 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP45Q9UL16 551 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 KIF3AQ9Y496 699 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 PFKFB2O60825 505 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 RESTQ13127 1097 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 UQCRHP07919 91 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 BRINP3Q76B58 766 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 APOBRQ0VD83 1088 aa21.58■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 GORABQ5T7V8 394 aa21.58■■□□□ 1.05
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 E7EWF7 191 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 MAST3O60307 1309 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 NR1I2O75469 434 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TPM3P06753 285 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PGBD1Q96JS3 809 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TJP1Q07157 1748 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 AP5Z1O43299 807 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 LUZP1Q86V48 1076 aa21.55■■□□□ 1.04
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