RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 SPACA7Q96KW9 195 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.28□□□□□ -0.92
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RABGGTB-205ENST00000462042 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.939e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF25Q93038 417 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 SETDB2Q96T68 719 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 AK5Q9Y6K8 562 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.25□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.25□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 C12orf49Q9H741 205 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-205ENST00000462042 BCO2Q9BYV7 579 aa9.22□□□□□ -0.93
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RABGGTB-205ENST00000462042 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.21□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 GGA1Q9UJY5 639 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.21□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 PI16Q6UXB8 463 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM161BQ96MY7 647 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 MDFIQ99750 246 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.948e-15■■■■□ 24
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RABGGTB-205ENST00000462042 GRM2Q14416 872 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.19□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PBX4Q9BYU1 374 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.19□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 J3QW42 95 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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RABGGTB-205ENST00000462042 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CCNJLQ8IV13 435 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC9Q92623 222 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 BACH2Q9BYV9 841 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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