RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460976.5

CTBP2-206, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-206	ENST00000460976	CNTNAP1	P78357	1384 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	ECE2	O60344	883 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	UFL1	O94874	794 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	GCKR	Q14397	625 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	GGA1	Q9UJY5	639 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	RTL9	Q8NET4	1388 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	LINS1	Q8NG48	757 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	XDH	P47989	1333 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	SCN9A	Q15858	1988 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	PSMD14	O00487	310 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	DOK7	Q18PE1	504 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	GREM2	Q9H772	168 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
CTBP2-206	ENST00000460976	PSME4	Q14997	1843 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF521	Q96K83	1311 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	DPF2	Q92785	391 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976		G3V3G9	751 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976		H7C1D1	291 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	CASP7	P55210	303 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	MICALL2	Q8IY33	904 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	ATP2B4	P23634	1241 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976		F6X3S4	739 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	IFFO2	Q5TF58	517 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	SHTN1	A0MZ66	631 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CTBP2-206	ENST00000460976	RASSF10	A6NK89	507 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	33.57	■■■□□ 2.96	4e-7	■■■■■ 44.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	TRAF5	O00463	557 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	BEND3	Q5T5X7	828 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	ITGA6	P23229	1130 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	VEGFB	P49765	207 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	FAM161A	Q3B820	660 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	CSF1R	P07333	972 aa		33.54	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	MED23	Q9ULK4	1368 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF609	O15014	1411 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CTBP2-206	ENST00000460976	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	CST9	Q5W186	159 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	PODN	Q7Z5L7	613 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976		A0A1B0GUL6	1792 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976		E9PSI1	815 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	GRM8	O00222	908 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	ALDH1L1	O75891	902 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	EGFR	P00533	1210 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	FOXO4	P98177	505 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTBP2-206	ENST00000460976	USP17L3	A6NCW0	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	USP17L4	A6NCW7	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	ECE1	P42892	770 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	USP48	Q86UV5	1035 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	CHRND	Q07001	517 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CTBP2-206	ENST00000460976	CAPNS2	Q96L46	248 aa		33.41	■■■□□ 2.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms