RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 EYA3Q99504 573 aa23.07■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.07■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 LTBP1Q14766 1721 aa23.07■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 XDHP47989 1333 aa23.07■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.07■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 AOC3Q16853 763 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 NIM1KQ8IY84 436 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 MEIS3Q99687 375 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 GGA1Q9UJY5 639 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.06■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 UFL1O94874 794 aa23.05■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.05■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 ATP2B4P23634 1241 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 WASHC4Q2M389 1173 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 POLLQ9UGP5 575 aa23.04■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
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DDR1-241ENST00000460944 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.03■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.03■■□□□ 1.28
DDR1-241ENST00000460944 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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DDR1-241ENST00000460944 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 COL4A5P29400 1685 aa23■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 FZD9O00144 591 aa23■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 RIMBP2O15034 1052 aa23■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 GNAI2P04899 355 aa23■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 CHRNDQ07001 517 aa23■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 A0A1B0GUL6 1792 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 KCNJ4P48050 445 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 PANK1Q8TE04 598 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.99■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 G3V3G9 751 aa22.98■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.98■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 PLIN1O60240 522 aa22.97■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.97■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.96■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 MED23Q9ULK4 1368 aa22.96■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 WDR90Q96KV7 1748 aa22.96■■□□□ 1.27
DDR1-241ENST00000460944 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 GPC2Q8N158 579 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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DDR1-241ENST00000460944 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 ECE2O60344 883 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 TAF5LO75529 589 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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DDR1-241ENST00000460944 MTX1Q13505 466 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 PDE3AQ14432 1141 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 DOK7Q18PE1 504 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 SCN4AP35499 1836 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 EYA2O00167 538 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-241ENST00000460944 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 TNIP1Q15025 636 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 LRRC24Q50LG9 513 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 METTL24Q5JXM2 366 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-241ENST00000460944 COG6Q9Y2V7 657 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.91■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 KIF3CO14782 793 aa22.91■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 CXCL9Q07325 125 aa22.91■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 YDJCA8MPS7 323 aa22.9■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 RAD17O75943 681 aa22.9■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 SIL1Q9H173 461 aa22.9■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.9■■□□□ 1.26
DDR1-241ENST00000460944 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 UBE4AQ14139 1066 aa22.89■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 COA1Q9GZY4 146 aa22.89■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 COPRSQ9NQ92 184 aa22.89■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 SCN9AQ15858 1988 aa22.89■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 CIAO1O76071 339 aa22.88■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 PODNQ7Z5L7 613 aa22.88■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 PSME4Q14997 1843 aa22.87■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 SNAP23O00161 211 aa22.87■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 PDE8BO95263 885 aa22.87■■□□□ 1.25
DDR1-241ENST00000460944 KLRK1P26718 216 aa22.87■■□□□ 1.25
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