RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 LRRC24Q50LG9 513 aa24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 CCDC192P0DO97 292 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 LIG1P18858 919 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 CAMK4Q16566 473 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 KLHL34Q8N239 644 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 DDX11Q96FC9 970 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 PALLDQ8WX93 1383 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 BRINP3Q76B58 766 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 GPR108Q9NPR9 543 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 H3BQV1 296 aa24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 EYA2O00167 538 aa24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 IFFO2Q5TF58 517 aa24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K11Q16584 847 aa24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 SCRN1Q12765 414 aa24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 DACT1Q9NYF0 836 aa24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GUL7 405 aa24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 TERF1P54274 439 aa24.19■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 IL2RBP14784 551 aa24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 TNMDQ9H2S6 317 aa24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.17■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.17■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 STRN4Q9NRL3 753 aa24.17■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 HSPA2P54652 639 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 APOBRQ0VD83 1088 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 RESTQ13127 1097 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 BICD2Q8TD16 824 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 A0A0G2JLW4 131 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 AP5Z1O43299 807 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 CIAO1O76071 339 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 MAST3O60307 1309 aa24.16■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 PFKFB2O60825 505 aa24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 FOSBP53539 338 aa24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 TYRO3Q06418 890 aa24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 ATG3Q9NT62 314 aa24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
IMP4-208ENST00000460766 E7EWF7 191 aa24.14■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 GORABQ5T7V8 394 aa24.14■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 PGBD1Q96JS3 809 aa24.14■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.14■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NR1I2O75469 434 aa24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CHST3Q7LGC8 479 aa24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TJP1Q07157 1748 aa24.13■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 M0R2C6 588 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 UQCRHP07919 91 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CFAP45Q9UL16 551 aa24.12■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TCIRG1Q13488 830 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TICAM2Q86XR7 235 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 CTDNEP1O95476 244 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 EVA1CP58658 441 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 LUZP1Q86V48 1076 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-208ENST00000460766 PPFIA3O75145 1194 aa24.1■■□□□ 1.45
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