RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RTL9Q8NET4 1388 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CACNA1FO60840 1977 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RIMBP2O15034 1052 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP48Q86UV5 1035 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGS19P49795 217 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HUNKP57058 714 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF428Q96B54 188 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDE8AO60658 829 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EGFRP00533 1210 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DOK7Q18PE1 504 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 APAF1O14727 1248 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGMBQ6NW40 437 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AGBL3Q8NEM8 1001 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC102AQ96A19 550 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYD88Q99836 296 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SEC31BQ9NQW1 1179 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TSKSQ9UJT2 592 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGA1Q9UJY5 639 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UFL1O94874 794 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 XDHP47989 1333 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPEF2Q9C093 1822 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SULF1Q8IWU6 871 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZIC5Q96T25 663 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADM5C9JUS6 153 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 G3V3G9 751 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DLK2Q6UY11 383 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PODNQ7Z5L7 613 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GMLQ99445 158 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP2B4P23634 1241 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FKBP1BP68106 108 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KSR2Q6VAB6 950 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGA3Q9NZ52 723 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MED23Q9ULK4 1368 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP17L3A6NCW0 530 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP17L4A6NCW7 530 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV5-2P06315 115 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC10A3P09131 477 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MMP14P50281 582 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTSWP56202 376 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC27Q2M243 656 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM161AQ3B820 660 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP17L1Q7RTZ2 530 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDCA5Q96FF9 252 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP17L8P0C7I0 530 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DGKZQ13574 1117 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCARF1Q14162 830 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TSPYL6Q8N831 410 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms