RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTL9Q8NET4 1388 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UFL1O94874 794 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCNTO95613 3336 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ECE2O60344 883 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM161AQ3B820 660 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PSMD14O00487 310 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLFN5Q08AF3 891 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCER2I3L3R5 266 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNTROBQ8N137 903 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JMYQ8N9B5 988 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GGA1Q9UJY5 639 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EYA3Q99504 573 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XDHP47989 1333 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 E9PSI1 815 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CSF1RP07333 972 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FOXO4P98177 505 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CREBZFQ9NS37 354 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ITGA6P23229 1130 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNIP1Q15025 636 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EGFRP00533 1210 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MICALL2Q8IY33 904 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAF5O00463 557 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP2B4P23634 1241 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KLRK1P26718 216 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRM8O00222 908 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNTNAP1P78357 1384 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MED23Q9ULK4 1368 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALDH1L1O75891 902 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KAZALD1Q96I82 304 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUCLG2Q96I99 432 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNAP23O00161 211 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DPF2Q92785 391 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHRNDQ07001 517 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DLK2Q6UY11 383 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIER1Q8N108 512 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF609O15014 1411 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CST9Q5W186 159 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 G3V3G9 751 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H7C1D1 291 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MXD3Q9BW11 206 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UTYO14607 1347 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAF5LO75529 589 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VEGFBP49765 207 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GMLQ99445 158 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTPRCP08575 1304 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RASSF10A6NK89 507 aa18.28■□□□□ 0.52
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