RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	FKTN	O75072	461 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	BRCA2	P51587	3418 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MYL6B	P14649	208 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	CEP290	O15078	2479 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	BBOX1	O75936	387 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	TM4SF4	P48230	202 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667		H0YGN5	161 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	MAP3K13	O43283	966 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	ECE2	O60344	883 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	SCARF1	Q14162	830 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	COL6A3	P12111	3177 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	FKBP1B	P68106	108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	GRAP	Q13588	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	COL4A1	P02462	1669 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	GPSM2	P81274	684 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PRKG1	Q13976	671 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDZK1-204	ENST00000443667	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	CAP1	Q01518	475 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF609	O15014	1411 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ANXA1	P04083	346 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	PSME4	Q14997	1843 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDZK1-204	ENST00000443667	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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