RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

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Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 IGFBP4P22692 258 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SERPINB4P48594 390 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.7□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TNFRSF10AO00220 468 aa5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 NNTQ13423 1086 aa5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 COL26A1Q96A83 441 aa5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.69□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 PAPPAQ13219 1627 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 POTECB2RU33 542 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 LGR5O75473 907 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ADH1AP07327 375 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 EPHA4P54764 986 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 FOXC1Q12948 553 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SERTAD1Q9UHV2 236 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.68□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ST8SIA5O15466 376 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ABL1P00519 1130 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SCNN1AP37088 669 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 MTFR1Q15390 333 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TNS4Q8IZW8 715 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ITSN1Q15811 1721 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 AKAP12Q02952 1782 aa5.67□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 A6NJY4 79 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 H3BRB1 525 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ERCC3P19447 782 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SMTNP53814 917 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 VPS72Q15906 364 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 NBPF15Q8N660 670 aa5.66□□□□□ -1.5
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CYCSP43-201ENST00000438233 XAGE2Q96GT9 111 aa5.66□□□□□ -1.5
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CYCSP43-201ENST00000438233 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 AAASQ9NRG9 546 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 PIK3C2GO75747 1445 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ADGRB1O14514 1584 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 C21orf2O43822 256 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 GDF9O60383 454 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ICMTO60725 284 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 IL2RAP01589 272 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 FOXK2Q01167 660 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 CLN3Q13286 438 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 TLR1Q15399 786 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 Q6ZVU0 165 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 CYP4X1Q8N118 509 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 CNKSR1Q969H4 720 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ITPKCQ96DU7 683 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 SEPT3Q9UH03 358 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.65□□□□□ -1.5
CYCSP43-201ENST00000438233 NUP155O75694 1391 aa5.65□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.65□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.65□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 AXIN1O15169 862 aa5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 WIPF1O43516 503 aa5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 PTGIRP43119 386 aa5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 CBLBQ13191 982 aa5.64□□□□□ -1.51
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM182BQ5T319 152 aa5.64□□□□□ -1.51
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